Чи можливо не погодитися з наказом керівника про призупиненням дії...

Так можно. В случае несогласия работника с приказом работодателя о приостановлении действия трудового договора работником или профсоюзом по поручению работника соответствующий приказ может быть обжалован в центральный орган исполнительной власти, реализующий государственную политику по надзору и контролю за соблюдением законодательства о труде, или его территориального органа, который , изучив содержание приказа (распоряжения) и основания его издания, по согласованию с военной администрацией может внести работодателю предписание об отмене соответствующего приказа (распоряжения) или об устранении нарушения законодательства о труде другим путем, что является обязательным к исполнению работодателем в течение 14 календарных дней со дня получения такого предписания.