Будет ли действителен договор аренды квартиры на оккупированной территории?

Да, будет действительным. Для решения договора аренды не нужно его нигде регистрировать, а значит и обращаться в органы Украины. Договор заключается в письменной форме между арендодателем и арендатором.

Возможно вам будет полезна эта информация, что в соответствии с частью 6 статьи 762 Гражданского кодекса Украины арендатор освобождается от арендной платы за все время, в течение которого он не мог пользоваться арендованным имуществом из-за обстоятельств, за которые он не отвечает.