При відмові від проходження ВЛК не можна застосовувати ч. 2 ст. 28 Конституції України, де вказується, що жодна людина без її вільної згоди не може бути піддана медичним, науковим чи іншим дослідам. Адже при проходженні ВЛК здійснюється медичний огляд, а не досліди. Крім того, ст. 43 Основ законодавства України про охорону здоров’я, котра закріплює необхідність отримання згоди пацієнта для застосування методів діагностики, профілактики та лікування, також не може братись до уваги як підстава відмови. Адже ця норма є загальною поряд зі спеціальною нормою Закону України “Про військовий обов’язок і військову службу”, що фіксує обов’язок проходження ВЛК, яка і має застосовуватись в даному випадку.
Проте, законодавство не забороняє громадянину відмовитись від ВЛК, разом із тим встановлюючи відповідальність за таку відмову.